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医疗机构护士变更注册的流程包括以下步骤。
1、填写注册申请表：登录中华人民共和国国家卫生健康委员会官网，在“护士电子化注册系统”中填写注册相关信息并导出打印申请表。
2、准备相关材料：包括护士执业证书原件或复印件、医疗卫生机构聘用证明原件等，如果是首次注册，还需要提供医疗卫生机构拟聘用护士名单表以及实习机构出具的实习证明原件等，如果申请人是跨省变更注册，还需要提交原注册部门出具的变更注册证明原件。
3、现场办理或网上办理：根据所在地的要求，可以选择现场办理或网上办理，如果选择现场办理，需要携带相关材料前往当地的卫生行政部门进行现场申请，如果选择网上办理，需要在相应的网站或平台上进行申请并提交相关电子材料。
4、审核与发证：提交申请后，等待卫生行政部门的审核，审核通过后，会发放新的护士执业证书或者变更注册的证明文件。
不同地区和机构可能有不同的规定和要求，建议查询所在地的具体规定或联系相关部门进行确认，以上流程仅供参考，具体流程可能因实际情况而有所不同。